内分泌检查的最佳时间因检查项目而异。一般来说，性激素六项检查通常在月经来潮后的第2-5天进行，这时候属于卵泡早期，能反映卵巢的基础功能；而甲状腺功能检查随时都可以进行，不受进食等因素太大影响。
性激素六项检查时间
基础状态下检查：月经周期第2 - 5天（卵泡早期）进行性激素六项检查，能较好反映卵巢的基础内分泌状态。比如通过检测促卵泡生成素（FSH）、促黄体生成素（LH）、雌二醇（E2）等指标，可了解卵巢的储备功能等情况。特定情况随时查：如果是闭经、长期不来月经的女性，可随时检查，这时候相当于基础状态。另外，若需要了解孕激素水平，判断是否排卵等情况，则在月经周期的第21 - 22天左右检查比较合适，此时接近黄体期晚期，能较好反映孕激素水平。
甲状腺功能检查时间
不受进食影响：甲状腺功能检查中的甲状腺激素（T3、T4）、促甲状腺激素（TSH）等指标，一般不受进食与否的影响，所以随时都可以去检查。比如早上空腹或者饭后去医院抽血检查都可以，结果相对稳定。不过，若正在服用影响甲状腺功能的药物，最好在医生指导下调整用药后再进行检查，以免药物干扰检查结果。
血糖相关内分泌检查时间
空腹血糖检查：如果是检查空腹血糖相关的内分泌情况，比如怀疑有糖尿病倾向等，需要空腹8 - 12小时后抽血，一般建议早上7 - 9点之间抽血，此时血糖水平能较好反映基础状态下的血糖情况。糖耐量试验时间：做口服葡萄糖耐量试验时，需要在空腹状态下抽取空腹血糖，然后口服75克葡萄糖，分别在服糖后30分钟、1小时、2小时、3小时抽取血糖等指标，通过这些不同时间点的血糖变化来评估糖代谢情况，判断是否存在糖耐量异常等内分泌相关的糖代谢问题。