射精后小肚子疼可能由生理性原因、精囊炎、前列腺炎等导致，需对症治疗。
一、生理性原因：患者在射精时周围肌肉会猛烈收缩，射精后肌肉出现疲劳就可能有小腹疼痛症状，尤其是性生活较频繁的患者更易出现，通常可自行恢复。
二、精囊炎：
1.这是一种以血精为主要特征的疾病，常有会阴部不适、尿频、尿急、尿痛等局部症状，或发热、恶寒、寒战等全身性症状，常与前列腺炎同时发生。
2.精囊炎患者需要做的检查包括精液常规检查、精囊造影、超声波检查、精道造影术等，通过这些检查，医生能明确病因、了解病情，进而制定个体化治疗方案。
三、前列腺炎：
1.主要表现为会阴部放射性疼痛、坠胀、滴白，伴有全身乏力、夜尿多、腰膝酸软、失眠多梦及性功能障碍等。
2.治疗细菌感染的前列腺炎，常用药物有左氧氟沙星、头孢克肟、阿奇霉素等；非细菌感染导致的前列腺炎可用盐酸坦索罗辛缓释胶囊治疗。药物使用需严格遵医嘱。
当患者出现射精后小肚子疼且长时间不能缓解时，应及时去医院检查并对症治疗。