美尼尔氏综合症的病因目前尚未完全明确，但一般认为与多种因素有关。目前研究发现，内耳膜迷路积水可能是其主要病理基础，而引发内耳膜迷路积水的因素较多。
内耳解剖与发育因素
先天性发育异常： 部分患者可能存在先天性内耳发育异常，比如内耳解剖结构的变异可能影响内淋巴液的正常循环。有研究发现，约10% - 15%的美尼尔氏综合症患者存在一定程度的先天性内耳结构发育上的微小差异，这种差异可能在后天因素诱发下导致发病。膜迷路机械阻塞与内淋巴吸收障碍： 内耳中的一些结构如前庭导水管狭窄等，可能会引起膜迷路机械阻塞，使得内淋巴液吸收出现障碍。正常情况下，内淋巴液的产生和吸收处于动态平衡，当这种平衡被打破，内淋巴液积聚，就会导致膜迷路积水，进而引发美尼尔氏综合症相关症状。
感染因素
病毒感染： 多种病毒感染可能与美尼尔氏综合症的发生有关。例如，腮腺炎病毒、麻疹病毒、流感病毒等感染内耳后，可能会引起内耳的炎症反应，影响内耳的正常功能。有临床统计显示，约20%的美尼尔氏综合症患者在发病前有过病毒感染的病史，病毒感染引发的免疫反应可能导致内耳组织的损伤，从而诱发美尼尔氏综合症。细菌感染： 细菌感染也可能波及内耳，引发炎症。如中耳的细菌感染蔓延至内耳，引起内耳的炎症性病变，干扰内耳的正常生理功能。不过相对病毒感染来说，细菌感染引发美尼尔氏综合症的比例相对低一些，但也不可忽视。
免疫因素
自身免疫反应： 自身免疫因素在美尼尔氏综合症的发病中起到一定作用。人体的免疫系统可能错误地攻击内耳组织，导致内耳的损伤和功能紊乱。例如，体内可能产生针对内耳组织的自身抗体，这些抗体与内耳组织结合，引发免疫炎症反应，影响内耳的结构和功能，进而导致美尼尔氏综合症的发生。一些研究表明，约30%左右的美尼尔氏综合症患者存在自身免疫相关的异常表现。过敏反应： 过敏体质的人更容易发生过敏反应，而过敏反应也可能波及内耳。当接触到过敏原后，身体发生过敏反应，释放组胺等物质，这些物质可能影响内耳的血管通透性等，导致内耳的液体平衡失调，诱发美尼尔氏综合症。有数据显示，在美尼尔氏综合症患者中，约有15% - 20%同时合并有过敏相关疾病，如过敏性鼻炎等。
其他因素
精神心理因素： 长期的精神紧张、焦虑、抑郁等不良情绪可能与美尼尔氏综合症的发病有关。精神心理因素会影响人体的神经内分泌调节，进而影响内耳的血液循环和淋巴循环。例如，长期精神紧张会导致交感神经兴奋，引起内耳血管收缩，影响内耳的血液供应，从而增加美尼尔氏综合症的发病风险。临床观察发现，长期处于高压工作或生活状态下的人群，美尼尔氏综合症的发病率相对较高。劳累与睡眠因素： 过度劳累、睡眠不足等也可能诱发美尼尔氏综合症。劳累和睡眠不足会使身体的抵抗力下降，影响内耳的正常生理功能。当身体处于疲劳状态时，内耳的代谢功能可能受到影响，内淋巴液的产生和吸收平衡更容易被打破，从而增加发病的可能性。有研究指出，经常熬夜、长期从事高强度体力或脑力劳动的人群，美尼尔氏综合症的发病几率比正常人群高出约20%左右。