第三代试管婴儿的成功率受到多种因素影响，一般来说，在30%~60%左右。不过具体成功率会因不同的个体情况而有所差异。
影响第三代试管婴儿成功率的因素一：年龄因素
女性年龄： 女性年龄是影响第三代试管婴儿成功率的重要因素。一般来说，女性在25~34岁之间做第三代试管婴儿的成功率相对较高，可达到50%左右甚至更高；而随着年龄增长，尤其是超过35岁后，卵子质量和数量下降，成功率会逐渐降低，40岁以上的女性成功率可能会降到30%以下。男性年龄： 男性年龄也有一定影响，男性年龄过大，精子质量可能会下降，比如精子的活力、形态等方面出现问题，也会在一定程度上影响第三代试管婴儿的成功率，但相对女性年龄的影响程度稍低一些。
影响第三代试管婴儿成功率的因素二：不孕原因
输卵管因素： 如果是因输卵管堵塞、粘连等输卵管因素导致的不孕，做第三代试管婴儿的成功率相对较高，可能在40%~60%左右。因为输卵管问题主要影响卵子和精子的结合以及受精卵的运输，通过第三代试管婴儿技术可以绕过输卵管环节，直接将胚胎植入子宫。子宫内膜异位症： 患有子宫内膜异位症的患者做第三代试管婴儿的成功率相对会受到一定影响，成功率大概在30%~50%左右。子宫内膜异位症会影响子宫内膜的容受性，使得胚胎不容易着床。
影响第三代试管婴儿成功率的因素三：胚胎质量
胚胎染色体情况： 第三代试管婴儿主要是针对有染色体异常等问题的夫妇，通过筛查胚胎的染色体来选择健康的胚胎进行移植。如果胚胎本身染色体正常，移植成功率相对较高；如果胚胎存在染色体异常，即使进行了筛选，成功率也会受到影响，可能只有20%~40%左右。胚胎发育潜力： 胚胎的发育潜力也很关键，优质的胚胎（即发育速度正常、形态良好的胚胎）移植成功率更高，而发育潜力差的胚胎移植后成功着床的概率较低，可能成功率在20%以下。