卵巢囊肿的治疗方式主要有微创手术、经阴道手术和开腹手术。微创手术即腹腔镜手术，传统腹腔镜一般是在肚脐、左下腹和右下腹共打3至4个孔进行手术，还有单孔腹腔镜是在脐部打一个约3cm切口来手术。一、对于复杂、有粘连或破裂可能性大的卵巢囊肿，不适合单孔手术。二、对于有性生活的女性，若囊肿不大且无明确粘连，可经阴道手术，能避免腹部瘢痕形成。三、当卵巢囊肿过大或考虑有恶性可能、破裂可能性极大时，易造成盆腹腔种植和播散，此时需考虑是否进行开腹手术，开腹手术创伤和损伤较大，但若是恶性，对患者保护十分必要。
总之，卵巢囊肿的治疗方式需根据具体情况来选择，以达到最佳的治疗效果和最小的伤害。