眼睛睫毛根部长小疙瘩，可能是以下原因引起：
1.麦粒肿：麦粒肿是睫毛毛囊附近的皮脂腺或睑板腺的急性化脓性炎症。通常表现为眼睑局部红肿、疼痛，有时会在睫毛根部出现小疙瘩。麦粒肿可在医生的指导下使用抗生素眼膏，如红霉素眼膏、金霉素眼膏等进行治疗。如果麦粒肿形成了脓肿，需要切开排脓。
2.霰粒肿：霰粒肿是一种慢性肉芽肿性炎症，通常是由于睑板腺排出管道阻塞，分泌物潴留引起的。霰粒肿一般无明显症状，有时会在眼睑上发现不痛不痒的小肿块。较小的霰粒肿可以通过热敷促进其吸收，如果霰粒肿较大，需要手术治疗。
3.眼部感染：如结膜炎、角膜炎等，也可能导致睫毛根部出现小疙瘩，并伴有眼部红肿、疼痛、分泌物增多等症状。需要根据感染的病原体选择合适的抗生素或抗病毒药物进行治疗。
4.过敏：如果对化妆品、洗发水、眼药水等过敏，也可能引起眼部过敏反应，导致睫毛根部出现小疙瘩。需要避免接触过敏原，并使用抗过敏药物进行治疗。
5.其他：如皮脂腺囊肿、乳头状瘤等也可能导致睫毛根部出现小疙瘩。
如果发现眼睛睫毛根部长小疙瘩，建议及时就医，明确诊断，并在医生的指导下进行治疗。同时，要注意眼部卫生，避免揉眼，避免使用刺激性的化妆品和眼药水。