临床对于新生儿心肌酶升高一般住院几天并没有明确规定，需综合考虑新生儿具体的恢复情况，可能需5至7天，也可能需要更久。建议在医生指导下及时完善心电图、心脏彩超等检查以助于诊断病情。
一、若新生儿自身身体素质较好，经积极治疗后多数恢复较快，这种情况下通常住院5天左右就可能出院。
1.新生儿心肌酶高多因羊水浑浊、宫内缺氧、脐带绕颈等导致心肌缺氧，进而引起心肌酶偏高。
2.缺氧酸中毒时，心肌受损明显，心肌细胞代谢障碍，细胞通透性增强，从而出现心肌酶活性增高。
3.此时新生儿常表现出精神状态差及缺氧症状。
二、若新生儿自身体质较差、恢复较慢且病情较为严重，通常需要住院7天或更长时间，需等到新生儿症状完全恢复正常后，根据专业医生建议方可出院。对于这种情况，建议遵医嘱予以维生素C注射液保护心肌。
出院后，家长应定期带新生儿去医院复查，一般为1个月1次，以及时了解新生儿恢复情况。同时在日常生活中应加强对新生儿的营养补充，这在一定程度上可促进新生儿疾病恢复。
总之，新生儿心肌酶升高后的住院时间因人而异，要根据具体情况判断，出院后也需做好相关护理和复查。