生理期进行入职体检可能会出现以下特殊情况：
1.尿常规异常：生理期时，经血可能混入尿液样本，导致红细胞和潜血假阳性。如果医生发现尿液中有红细胞，可能会怀疑泌尿系统结石、感染或肿瘤等问题。此时，你可以告知医生实情，要求择期复查。
2.妇科检查结果不准确：生理期时，子宫内膜脱落，宫颈口微开，进行妇科检查可能会将经血带入子宫，影响检查结果的准确性。如果你需要进行妇科检查，最好在生理期结束后3-7天进行。
3.影响某些血液指标：生理期时，女性体内的激素水平会发生变化，可能会影响某些血液指标的检测结果，如雌二醇、孕激素等。如果你需要进行激素六项检查，最好在生理期结束后3-7天进行。
针对以上情况，你可以采取以下措施：
1.提前告知医生：在进行入职体检前，提前告知医生你的生理期情况，以便医生采取相应的措施，如调整检查项目或时间。
2.注意个人卫生：在生理期时，要注意个人卫生，保持外阴清洁，勤换卫生巾。
3.避免剧烈运动：在生理期时，避免剧烈运动和重体力劳动，以免加重生理期不适。
总之，生理期进行入职体检可能会对某些检查项目的结果产生影响，你可以提前告知医生，采取相应的措施，以保证体检结果的准确性。