甲减主要通过服药补充甲状腺素进行治疗，一般为口服左旋甲状腺素，用药与否通常根据甲功三项尤其是促甲状腺激素（TSH）情况来决定。
一、当促甲状腺激素（TSH）≧7.5miu/mL时，应立即补充甲状腺素。
1.普通成人TSH≧7.5miu/mL就需用药补充甲状腺素，不然可能逐渐对身体产生显著危害。
2.若是孕期，对TSH的要求通常更低。
二、当促甲状腺激素（TSH）介于4.5～7.5miu/mL时，要根据年龄与症状来评估是否给药。
1.70岁以上老年人检查出甲状腺功能轻微不足时，一般不建议立刻补充甲状腺素，因为这很可能是正常老化过程，有时补充后病人未必能确切获得好处。
2.对于年纪较轻且甲状腺功能轻微不足的病人，可以考虑用药补充甲状腺素，但会给病人一段时间考虑，每3个月回诊抽血追踪2～3次，大约3～5成病人会在1年后恢复正常，这是因为免疫有起伏性，有时免疫高峰期过去，甲状腺会恢复正常运作，但如果一直未恢复，就可考虑用药治疗。
总之，对于甲减的治疗，要依据促甲状腺激素的具体数值以及患者的年龄、症状等情况来综合判断是否用药以及如何用药。