通常来说，小孩在医生指导下使用益生菌通常不会有副作用，但自行盲目使用则可能产生副作用。益生菌属于微生态制剂，其具有多方面的作用：
一、能帮助调节机体菌群，维持肠道菌群结构的平衡。
二、可促进机体营养的吸收。
三、能保持肠道健康，保护肠道黏膜屏障。
临床上，益生菌主要用于治疗便秘、腹泻等症状，若小孩出现此类症状，遵医嘱使用该药物进行缓解，一般不会出现副作用，无需过度担忧。然而，如果小孩并未出现不适症状却自行盲目使用，可能会干扰正常的肠道屏障作用，导致肠道正常菌群失调，进而出现肠胃不适等情况，对身体健康不利。所以，益生菌必须在医生的指导下使用，使用后还应留意观察是否出现不良反应。要是使用该药物后出现不适症状，应及时前往医院就诊，并遵医嘱进行相应处理。
总之，小孩使用益生菌要谨慎，严格遵循医生指导，避免自行随意使用带来不良后果。