十二指肠息肉的治疗方法需根据息肉的大小、形态等情况来定，一般较小的息肉可在内镜下切除，比如直径小于2厘米的无蒂息肉可通过内镜下黏膜切除术（EMR）处理。
内镜下治疗为主
小息肉内镜切除：如果十二指肠息肉比较小，直径在1厘米以内，且没有明显症状，通常可以在内镜下直接钳除。这种方法创伤小，恢复快，一般术后观察1 - 2天若无异常就能出院。较大息肉内镜处理：对于直径在1 - 2厘米的息肉，可能需要用内镜下黏膜切除术（EMR）。医生会在息肉周围注射生理盐水等使黏膜隆起，然后用圈套器将息肉套住切除，术后要注意创面情况，避免出血等并发症。
手术治疗情况
息肉较大且恶变倾向：如果息肉较大，直径超过2厘米，或者怀疑有恶变可能，就需要考虑外科手术治疗。比如息肉基底较宽，内镜下切除风险较高时，可能需要做部分十二指肠切除手术。手术创伤相对较大，术后恢复时间较长，一般需要住院1 - 2周左右。
术后康复与随访
术后饮食注意：术后初期要吃清淡、易消化的食物，如米粥、面条等，避免吃辛辣、油腻、刺激性食物，一般术后1 - 2天可逐渐过渡到正常饮食，但要注意少食多餐。定期随访：不管是内镜下切除还是手术治疗，都需要定期进行胃镜复查。一般术后3个月要做第一次胃镜复查，观察创面恢复情况以及有无复发等；之后可根据情况半年或一年复查一次胃镜。