胃长期不消化可以选用促胃肠动力药、消化酶制剂等药物。一般来说，促胃肠动力药如多潘立酮，能促进胃肠道蠕动，通常起效较快。
促胃肠动力药
多潘立酮： 可促进胃排空，增强胃窦和十二指肠运动，协调幽门的收缩，适用于由胃排空延缓、胃肠道反流等引起的消化不良。成人常用，但需注意1岁以下婴儿由于其血脑屏障发育不完善，应用时可能引发神经方面的不良反应。莫沙必利： 选择性作用于5-羟色胺4（5-HT4）受体，促进乙酰胆碱释放，增强胃肠道运动，改善功能性消化不良的相关症状，老年人使用时一般需监测不良反应。
消化酶制剂
复方消化酶： 含有胃蛋白酶、木瓜酶、淀粉酶等多种消化酶，能促进碳水化合物、脂肪、蛋白质的消化吸收，可用于因消化酶缺乏引起的消化不良。但对本品过敏者禁用，服用时应注意不要嚼碎药片。米曲菌胰酶片： 由米曲菌霉提取物和胰酶组成，米曲菌霉提取物可补充植物性酶，胰酶可补充动物性酶，能改善因消化功能不良引起的腹部不适等症状，孕妇及哺乳期妇女使用前需咨询医生。
抑制胃酸分泌药
奥美拉唑： 属于质子泵抑制剂，通过抑制胃壁细胞的H+-K+-ATP酶来抑制胃酸分泌，对于因胃酸分泌过多导致消化不良的患者有帮助。但严重肾功能不全者及婴幼儿禁用，长期使用可能影响维生素B12吸收等。雷贝拉唑： 作用机制与奥美拉唑类似，也是抑制胃酸分泌，适用于胃酸相关的消化不良情况。肝肾功能不全者需调整剂量，老年人使用时要关注不良反应。