掌跖脓疱症的治疗需综合多种方式，一般可通过药物治疗、物理治疗等方法来改善。通常可以采用局部外用药物结合系统用药等方式。比如局部外用糖皮质激素软膏，像卤米松乳膏等有一定作用，但具体治疗方案需根据病情制定。
局部外用药物治疗
糖皮质激素软膏： 如卤米松乳膏，能起到抗炎、抗过敏的作用，可减轻局部的炎症反应，缓解脓疱、瘙痒等症状。但长期使用可能会有皮肤萎缩等不良反应，所以要在医生指导下使用，且不宜大面积长期应用。维A酸类药物： 像他扎罗汀凝胶，能调节表皮细胞的增殖和分化，对掌跖脓疱症有一定的治疗效果。不过使用后可能会出现局部刺激症状，如红斑、脱屑等，使用时要注意避免接触正常皮肤。
系统药物治疗
免疫抑制剂： 如甲氨蝶呤，可抑制细胞的增殖，减轻炎症反应。但甲氨蝶呤有一定的副作用，使用过程中需要定期监测血常规、肝功能等指标，孕妇禁用。抗生素： 部分患者可能合并有细菌感染，此时会使用抗生素治疗，如四环素类药物。不过使用抗生素要根据细菌培养和药敏试验结果来选择合适的药物，避免滥用导致耐药。
物理治疗
紫外线照射： 窄谱中波紫外线（NB-UVB）照射是常用的物理治疗方法之一。通过紫外线的照射，可以抑制表皮细胞的过度增殖，减轻炎症反应。一般需要多次治疗，治疗过程中要注意保护正常皮肤，避免紫外线过度照射引起损伤。PUVA治疗： 即补骨脂素联合紫外线A照射，也可用于掌跖脓疱症的治疗。但该治疗方法需要服用补骨脂素，然后再进行紫外线照射，治疗过程中要注意观察不良反应，如光敏反应等，且孕妇、哺乳期妇女禁用。