大脑发育不全的症状因年龄阶段有所不同。一般在婴幼儿时期，可能表现为运动发育落后，比如3个月还不能抬头，4个月不能主动伸手抓物等；智力发育也会迟缓，对周围环境反应差，不会咿呀交流等。
运动方面的症状表现
大运动发育迟缓： 婴儿在相应月龄应达到的运动里程碑未达成，比如6个月大的婴儿正常能独坐片刻，而大脑发育不全的婴儿可能还不能独坐；1岁时正常能独站，大脑发育不全的婴儿可能站立困难。精细运动异常： 手指的精细动作发展缓慢，像10个月大的婴儿正常能用拇指和食指捡起小物体，大脑发育不全的婴儿可能很难完成这个动作，抓握东西时协调性差。
智力与语言方面的症状
智力落后表现： 对周围事物的认知能力差，比如对常见的物品名称、用途等理解困难；学习新事物的能力明显低于同龄人，比如教2岁的正常孩子认识水果，很快能记住，而大脑发育不全的孩子可能多次教导都难以理解。语言发育迟缓： 说话时间晚，正常孩子1岁左右开始说简单词语，大脑发育不全的孩子可能2岁还不会开口说简单字词；即使能说话，语言表达也不流畅，词汇量少，语句不完整。
感知觉与行为方面的症状
感知觉异常： 对声音、光线等刺激的反应异常，比如对很大的声响都没有明显惊吓反应；对疼痛、冷热等感觉的感知不敏感。行为异常表现： 可能出现异常的行为模式，比如经常出现双手握拳、身体僵硬的情况；或者行为刻板，长时间重复做同一个无意义的动作，像不停摇晃身体等。