怀孕两个多月查出有滴虫性阴道炎，需要及时就医，并在医生的指导下进行治疗。以下是一些治疗方法：
1.一般治疗：保持外阴清洁、干燥，避免搔抓。不食用辛辣刺激性食品。勤换内裤，用温水洗涤，不可与其他衣物混合洗，避免交叉感染。
2.局部治疗：可使用甲硝唑栓剂，每晚1次，连用7日。也可选用甲硝唑泡腾片，每晚1次，连用7~10日。
3.全身治疗：对不能耐受局部用药者、未婚妇女及不愿采用局部用药者，可选用口服药物。常用药物为甲硝唑，单次口服甲硝唑2g，治愈率高达90%~95%。
需要注意的是，在治疗期间，应避免性生活，同时性伴侣也需要进行治疗，以避免交叉感染。此外，孕妇应在医生的指导下使用药物，避免自行用药。如果治疗后症状没有缓解或出现加重，应及时就医复诊。