锁骨上方脖子根部疼痛的原因主要有以下这些：
一、落枕。这往往是由于夜间睡觉时枕头过高或过低，以及不良睡姿等因素，导致出现落枕情况，进而引起脖子疼痛不适的症状，通常这种状况在几天内可自然缓解。
二、脖子韧带拉伤。脖子过度劳累就容易导致颈部根部疼痛，此时可进行适当按摩、针灸治疗，同时要注意颈部保暖。
三、脖子受凉。胸锁乳突肌受凉后容易引发肌肉酸痛，所以要特别注意保暖。
四、淋巴结肿大或淋巴结炎。颈部反复牵拉引发炎症，再加上颈部经常运动就会使病情加剧，平时应注意饮食清淡，可涂抹非甾体类药物如吲哚美辛等来舒缓。
在日常生活中一定要注意脖子的防寒保暖，避免剧烈运动。倘若脖子疼痛持续不缓解，建议及时就医。
总结概况提示：锁骨上方脖子根部疼痛的原因包括落枕、韧带拉伤、受凉、淋巴结问题等，要根据不同情况采取相应措施，如自然缓解、按摩针灸、保暖、清淡饮食和用药等，持续疼痛不缓解需及时就医。