系统B超和四维彩超都是超声检查的方式，但存在不同。系统B超是二维超声的系统检查，主要侧重于对胎儿结构进行常规的详细检查，观察胎儿大体结构是否存在明显畸形等情况，检查时间相对固定，成像为二维平面图像。四维彩超是在三维彩超基础上加上时间维度，能实时获取胎儿活动的动态图像，像胎儿的吞咽、肢体活动等都可清晰呈现，检查时间相对灵活些。
成像原理方面
系统B超是基于二维超声成像原理，通过探头发射和接收超声波，经过计算机处理后形成二维的平面图像，主要用于获取胎儿器官等的结构切面信息。四维彩超则是在三维彩超的基础上，利用计算机软件对采集的数据进行处理，将其转化为动态的立体图像，能让医生看到胎儿在宫内的实时活动情况。
检查侧重点方面
系统B超更侧重于对胎儿各个器官系统进行全面、系统的排查，比如检查胎儿的头颅、脊柱、心脏、腹部脏器等结构是否存在明显的形态异常，是一种较为常规的全面筛查手段。四维彩超除了能进行系统的结构检查外，还能更直观地展现胎儿在宫内的活动姿态等，可用于胎儿的大排畸检查以及记录胎儿的活动影像等，让准父母能更直观地看到胎儿在宫内的样子。
适用情况方面
系统B超适用于常规的孕期胎儿结构筛查，一般在孕期的特定阶段进行全面的结构检查。而四维彩超除了可用于大排畸等结构筛查外，还可在一些需要观察胎儿实时活动情况的场景下使用，比如准父母想留存胎儿活动的影像资料等情况。对于一些特殊情况的孕妇，如既往有胎儿畸形史等，可能会根据具体情况选择系统B超或四维彩超进行更精准的检查。
检查时间安排方面
系统B超有相对固定的检查时间段，一般在孕中期的某个特定阶段进行较为系统全面的检查。四维彩超的检查时间相对灵活，可根据孕妇的情况和需求安排检查时间，但通常也建议在孕中期合适的时间进行大排畸等相关检查。在不同的孕期阶段，医生会根据孕妇的具体状况来决定选择系统B超还是四维彩超进行相应的检查，以保障胎儿健康相关信息的准确获取。