尿路结石形成原因较多，其中尿液中某些物质浓度过高是重要因素。比如尿液中钙、草酸、尿酸等成分排出量增加，就容易形成结石。像正常人尿液中钙的排泄量每天约为100 - 300毫克，当超过正常范围时，就增加了钙结石形成风险。
代谢异常相关原因
尿液成分异常：尿液中钙、草酸、尿酸、胱氨酸等浓度升高，就容易析出形成结石。例如尿钙增高，常见于甲状旁腺功能亢进等疾病，会使尿液中钙含量异常增多，增加钙结石形成可能；尿酸排泄过多则易引发尿酸结石。尿pH值改变：不同成分结石对尿液pH值要求不同。尿酸结石多在酸性尿中形成，而磷酸镁铵结石则易在碱性尿中形成。比如尿酸结石患者尿液pH值通常低于5.5，磷酸镁铵结石患者尿液pH值多高于7.2。
局部因素相关原因
尿路梗阻：尿路存在梗阻时，尿液排出不畅，会导致尿液中晶体物质容易沉积，进而形成结石。像先天性肾盂输尿管连接部狭窄、尿路结石等都可能引起梗阻。比如肾盂输尿管连接部狭窄的患儿，就较易在狭窄部位上方形成结石。尿路感染：感染时细菌、坏死组织等可作为核心，促使结石形成。而且感染产生的酶等物质会改变尿液成分，利于结石形成。例如变形杆菌感染可分解尿素产生氨，使尿液变碱性，促进磷酸镁铵等结石形成。
其他因素相关原因
饮食因素：长期摄入高嘌呤、高草酸、高钙食物易引发结石。比如长期大量吃动物内脏、菠菜等，菠菜中草酸含量高，大量摄入后会使尿液中草酸浓度升高，增加草酸钙结石形成风险；长期大量喝牛奶等高钙食物，也可能导致尿钙增高。药物因素：某些药物服用后可增加结石形成风险。例如磺胺类药物，其代谢产物易在尿液中析出形成结石；乙酰唑胺等药物也可能影响尿液成分，促使结石形成。