输卵管堵塞通常没有特定的口服药物能直接疏通堵塞，不过可以根据病因使用一些药物辅助治疗。比如因炎症引起的输卵管堵塞，可使用抗生素类药物，像头孢类抗生素等，一般需要规范使用1~2周左右来控制炎症，但这只是辅助，不能单纯靠吃药让堵塞的输卵管恢复通畅。
炎症相关药物辅助
盆腔炎引发的输卵管堵塞：如果是盆腔炎导致输卵管堵塞，常用抗生素来控制炎症。像头孢曲松钠联合多西环素，一般需要连续使用10~14天，通过抑制细菌生长繁殖，减轻盆腔炎症，从而在一定程度上缓解因炎症造成的输卵管轻度粘连等情况，但很难仅靠这些药完全疏通堵塞。附件炎导致的输卵管堵塞：附件炎引起的输卵管堵塞，也会用到抗生素，例如氧氟沙星联合甲硝唑，通常用药疗程也是1~2周，目的是消除附件部位的炎症，防止炎症进一步加重导致输卵管堵塞情况恶化。
内分泌调节相关药物
内分泌失调致输卵管功能异常：如果是内分泌失调影响输卵管功能进而出现堵塞相关情况，比如因雌激素水平异常，可能会使用雌激素类药物来调节。像戊酸雌二醇，需要按照医生制定的周期服用，一般连续服用21天为一个周期，通过调节内分泌，改善输卵管的蠕动等功能，但对已经形成的实质性堵塞作用不大。
中药辅助治疗
中医中药辅助：一些中药也可辅助治疗输卵管堵塞。比如活血化瘀类的中药，像丹参、桃仁等组成的方剂，可能需要长期服用，一般连续服用1~3个月左右，起到活血化瘀、通络的作用，有助于改善盆腔局部的血液循环，对缓解输卵管堵塞有一定帮助，但同样不能单纯依靠中药让堵塞的输卵管通畅。不过中药治疗需在专业中医医生辨证论治下进行，根据个体情况组方用药。