怀孕三周时不知道已怀孕而同房了，要着重留意是否有肚子疼痛、阴道分泌物增多、阴道出血等异常状况。要是没有异常，那就无需特殊处理。要是出现异常，必须马上就医。
一、如果在不清楚怀孕的情况下发生了同房行为，就需要密切观察有无腹痛、阴道分泌物增多、阴道出血等异常现象。要是没有异常症状，那就要做好观察，保持个人卫生清洁，要勤换洗衣物，每天用温开水清洗外阴，以防引发妇科炎症性疾病，从而影响受精卵的生长发育。
1.如果存在腹痛、阴道出血等异常情况，有可能是发生了先兆流产，建议要及时就医，遵医嘱使用黄体酮胶囊、地屈孕酮片等药物进行保胎治疗，避免对妊娠造成不良影响。
二、怀孕三周属于怀孕早期，此时受精卵着床还不太稳定，同房属于剧烈运动，可能会导致子宫过度兴奋，进而引起子宫阴道收缩，出现腹痛、阴道出血，甚至引发流产。而且在同房过程中可能会将细菌、病毒等致病微生物带入到阴道或宫内，从而引发感染，通常会出现阴道分泌物增多等症状，致使受精卵营养吸收不良，影响其成长发育。所以，怀孕早期不建议同房。
总之，怀孕三周时若有同房情况，要注意观察相关异常表现，根据具体情况及时采取相应措施，怀孕早期要避免同房以保障妊娠安全。