眼肌麻痹的治疗需根据具体病因来选择合适方式，一般来说，针对不同情况有不同的处理办法。比如由糖尿病性眼肌麻痹引起的，控制血糖是基础，通常需要将血糖控制在相对稳定的范围内，但具体治疗周期因个体血糖控制情况而异。
药物治疗方面
神经营养药物：常用的有维生素B1、维生素B12等。维生素B1能参与神经组织中糖代谢等过程，维生素B12对神经髓鞘合成有重要作用，可促进神经修复，但使用时要注意个体对药物的耐受情况等。糖皮质激素：如果是炎症性因素导致的眼肌麻痹，可能会用到糖皮质激素，如泼尼松等，它可以减轻炎症反应，但长期使用可能会有一些副作用，像导致血糖升高、骨质疏松等风险，使用时需在医生严密监测下进行。
手术治疗情况
斜视矫正手术：当眼肌麻痹导致斜视时，可考虑手术治疗。如果是水平方向的斜视，手术时机一般建议在病情稳定3~6个月后进行，这样能更好地评估斜视程度，制定合适的手术方案。眼眶减压手术：若眼肌麻痹是由眼眶病变等因素引起，比如甲状腺相关眼病导致眼肌麻痹，当药物治疗效果不佳时可能需要进行眼眶减压手术，手术能缓解眼眶内压力对眼肌等结构的影响，但手术有一定的风险，如出血、感染等。
康复治疗手段
眼肌训练：通过特定的眼肌训练来改善眼肌功能。一般每天可进行3~4次眼肌训练，每次10~15分钟左右，包括眼球上下左右转动、聚焦远近物体等训练，但要注意训练强度和频率要适中，避免过度训练导致眼肌疲劳。针灸治疗：针灸对眼肌麻痹也有一定的辅助治疗作用。可以选取睛明、球后、攒竹等眼部周围穴位以及合谷、太冲等全身穴位进行针灸，一般每周进行2~3次针灸治疗，一个疗程通常为10~15次，但针灸治疗效果因个体差异较大。