多囊卵巢综合征的病因目前尚未完全明确，但研究发现可能与以下因素有关。一般认为，遗传因素可能起到一定作用，据统计，约60% - 70%的患者存在遗传异常。
遗传因素方面
家族聚集性： 如果家族中有亲属患有多囊卵巢综合征，那么其他家族成员患病的风险会相对增加。这是因为遗传物质的传递可能将相关的致病基因传递给后代，使得后代更容易出现内分泌和代谢方面的异常。基因变异： 目前已经发现一些特定的基因变异与多囊卵巢综合征的发生相关。例如，某些参与激素合成、代谢以及胰岛素信号传导等通路的基因发生变异时，就可能影响身体的正常生理功能，从而增加患多囊卵巢综合征的几率。
内分泌失调方面
下丘脑 - 垂体 - 卵巢轴调节异常： 下丘脑分泌的促性腺激素释放激素（GnRH）和垂体分泌的促性腺激素（如促卵泡生成素FSH、促黄体生成素LH）之间的平衡失调是关键因素之一。正常情况下，LH与FSH的比例相对稳定，但在多囊卵巢综合征患者中，往往出现LH水平升高、FSH水平相对正常或降低，导致LH/FSH比值升高，进而影响卵巢的正常排卵功能，使得卵巢不能正常排出成熟卵子，同时还会刺激卵巢间质和卵泡膜细胞过度分泌雄激素，导致雄激素水平升高。胰岛素抵抗： 约50% - 70%的多囊卵巢综合征患者存在胰岛素抵抗现象。胰岛素抵抗是指机体对胰岛素的敏感性降低，为了维持正常的血糖水平，胰腺会分泌更多的胰岛素，形成高胰岛素血症。高胰岛素血症会通过多种途径影响卵巢功能，一方面刺激卵巢分泌过多雄激素，另一方面还会作用于下丘脑 - 垂体轴，促进LH的分泌，进一步加重雄激素的过量产生，形成恶性循环。
生活方式因素
饮食不规律： 长期高热量、高脂肪、高糖的饮食容易导致体重增加，而肥胖是多囊卵巢综合征的重要危险因素之一。例如，经常摄入过多油炸食品、甜品等，会使身体脂肪堆积，影响内分泌系统的正常功能，干扰激素的平衡。缺乏运动： 运动量过少会导致身体代谢减慢，脂肪更容易堆积，同时也会影响胰岛素的敏感性，增加胰岛素抵抗的发生风险，进而影响多囊卵巢综合征的发生发展。研究表明，坚持适量运动的人群患多囊卵巢综合征的几率相对较低。长期精神压力大： 长期处于高压力状态下，会导致身体内分泌系统紊乱，影响下丘脑 - 垂体 - 卵巢轴的正常调节，使得激素分泌失衡，增加多囊卵巢综合征的发病可能性。例如，长期面临工作压力、生活压力的人群，更容易出现月经不调、排卵异常等多囊卵巢综合征的相关表现。