月经来的时候吃止痛药，一般短期偶尔用问题不大，但长期或不恰当使用可能有一些坏处。比如可能会影响胃肠道功能，有的止痛药服用后可能出现恶心、呕吐、胃痛等不适，有研究发现约5% - 10%的人服用非甾体抗炎止痛药后会出现胃肠道不适症状。
对胃肠道的影响
刺激胃黏膜：像布洛芬这类非甾体抗炎止痛药，长期或大量服用时，会抑制胃黏膜前列腺素的合成，而前列腺素对胃黏膜有保护作用，缺少它就容易损伤胃黏膜，引发胃炎、胃溃疡等问题，严重的可能出现胃出血。影响肠道功能：还可能干扰肠道正常的蠕动和消化功能，导致消化不良、腹泻等情况。
对凝血功能的影响
延长出血时间：非甾体抗炎止痛药会抑制血小板的聚集功能，长期服用可能使出血时间延长。比如女性在月经期间本身就有出血情况，若凝血功能受影响，可能会让月经量比平时更多，或者经期延长。一般来说，长期服用这类止痛药的人群，出血风险会比正常人群略高。
对肝肾功能的影响
损害肝脏：部分止痛药需要经过肝脏代谢，长期服用可能加重肝脏负担，影响肝脏的正常功能。有研究显示，长期大量服用某些止痛药的人群，出现肝功能异常的概率比普通人高约2 - 3倍。影响肾脏：肾脏是药物排泄的重要器官，止痛药可能对肾脏血管产生影响，导致肾血流量减少，长期下去可能引起肾功能损害，尤其本身有肾脏基础疾病的人更要谨慎。
可能引起过敏反应
出现皮疹等症状：个别人群可能对止痛药中的某些成分过敏，服用后会出现皮肤瘙痒、皮疹等过敏表现。轻者可能只是局部皮肤有少量皮疹，重者可能全身出现大片皮疹，甚至引发过敏性休克，虽然这种情况相对少见，但一旦发生后果比较严重。