肛周湿疹可以使用的药物有多种，比如外用的糖皮质激素药膏，像氢化可的松乳膏，一般短期使用能起到抗炎、止痒的作用，但连续使用通常不建议超过2周。
外用药物治疗
糖皮质激素药膏： 这类药物能快速缓解肛周湿疹的瘙痒、炎症等症状。常见的有弱效的氢化可的松乳膏，它适用于轻度的肛周湿疹，能减轻局部的红肿、瘙痒情况。还有中效的曲安奈德益康唑乳膏，除了抗炎止痒外，对合并有真菌感染的肛周湿疹也有一定效果，但使用时要注意，不能长期大面积使用，以免引起皮肤萎缩等不良反应。钙调磷酸酶抑制剂： 如他克莫司软膏，适用于不宜使用糖皮质激素的部位，像肛周皮肤较薄嫩的地方。它通过抑制钙调磷酸酶来发挥作用，起效相对较慢，但长期使用不良反应相对较少，不过价格可能相对高一些。
口服药物治疗
抗组胺药： 可以缓解瘙痒症状。比如氯雷他定片，成人一般每天服用1次，每次10毫克，它能选择性地阻断组胺H₁受体，减轻过敏反应引起的瘙痒等症状。还有西替利嗪片，成人通常也是每天1次，每次10毫克，服用后可能会有轻微的嗜睡等不良反应，所以开车或操作机械的人要注意。
中药外洗治疗
中药复方外洗： 一些中药方剂也可用于肛周湿疹的治疗。比如用黄柏、苦参、地肤子、白鲜皮等中药煎水外洗。黄柏有清热燥湿的作用，苦参能清热燥湿、杀虫止痒，地肤子和白鲜皮也都有祛风止痒、清热燥湿的功效。一般将这些中药煎水后，待温度适宜时进行坐浴，每次坐浴15 - 20分钟左右，每天可进行1 - 2次，能起到一定的清热利湿、止痒的效果，但使用前最好咨询医生，根据个人情况调整药物组成。