夜里嘴苦可能由多种原因引起，比如口腔问题，像口腔卫生不佳时，细菌滋生可能导致夜里嘴苦，有研究发现约1/3的口腔问题患者会出现夜间嘴苦情况。
口腔相关因素
口腔卫生不良：如果不注意早晚刷牙、饭后漱口，食物残渣在口腔内残留，经过一夜的细菌发酵，就容易产生嘴苦的感觉。比如每天至少要刷牙2次，每次刷牙时间不少于3分钟，饭后最好能漱口。口腔疾病：像牙龈炎、龋齿等口腔疾病也可能引发夜里嘴苦。牙龈炎患者牙龈会红肿易出血，细菌滋生多，容易导致嘴苦；龋齿患者龋洞内容易残留食物，滋生细菌，从而出现嘴苦现象。
胃肠道问题
胆汁反流：当胃肠动力不足时，胆汁可能反流进入口腔，尤其是在夜间平卧时更易发生。比如一些患有胃食管反流病的人，就可能出现胆汁反流导致夜里嘴苦的情况。消化不良：晚餐吃得过饱、进食不易消化的食物等，会导致胃肠消化负担加重，食物在胃肠道内停留时间过长，发酵产生异味，可能向上反流引起嘴苦。一般建议晚餐不宜过饱，七八分饱即可，避免吃油腻、辛辣刺激且难消化的食物。
全身性疾病
肝胆疾病：胆囊炎、胆结石等肝胆疾病会影响胆汁的分泌和排泄，进而可能导致嘴里发苦。例如胆囊炎患者，胆汁排出不畅，夜里可能出现嘴苦症状。糖尿病：糖尿病患者如果血糖控制不佳，可能会出现嘴里发苦的情况，同时还可能伴有口干、多饮、多尿等症状。有数据显示，约10%的糖尿病患者会有口腔异味包括嘴苦的表现。