刚发现怀孕小肚子总疼，可能是以下原因引起：
1.正常生理现象：
怀孕后，子宫逐渐增大，可能会牵拉腹部及子宫圆韧带，引起小肚子疼痛。此外，怀孕后激素水平变化，也可能导致盆腔充血，出现下腹坠胀感或隐痛，一般休息后可缓解。
2.先兆流产：
如果除了小肚子疼痛，还伴有阴道少量出血，可能是先兆流产的表现。需要及时就医，进行保胎治疗。
3.宫外孕：
宫外孕是指受精卵在子宫体腔以外的部位着床。宫外孕时，随着孕囊的生长，会导致输卵管破裂，引起小肚子剧烈疼痛，甚至出现休克。如果怀孕后出现小肚子疼痛，同时伴有恶心、呕吐等症状，需要警惕宫外孕的可能，应及时就医，进行B超检查等，以明确诊断。
4.其他：
怀孕后，若合并卵巢肿瘤、子宫肌瘤等疾病，也可能出现小肚子疼痛。此外，膀胱炎、肠胃炎等疾病，也可能导致小肚子疼痛。
需要注意的是，怀孕后小肚子总疼，可能是正常的生理现象，也可能是异常情况引起。如果疼痛持续不缓解或伴有其他不适症状，应及时就医，进行相关检查，以明确原因，并在医生的指导下进行治疗。同时，在孕早期，要注意休息，避免剧烈运动和性生活，保持心情愉快，按时产检。