大拇指甲盖凹陷的原因包括外伤、感染以及指甲根部的甲母质部位出现异常等。
一、外伤：大拇指若曾经遭受过外伤，当甲根受到创伤时，就会导致指甲发生变形，进而呈现出指甲盖凹陷的情况。比如大拇指受到猛烈撞击或挤压等，都可能引起甲根受损，最终出现指甲盖凹陷现象。
二、感染：
1.细菌感染：某些细菌感染可能引发指甲盖凹陷，如甲沟炎等疾病。
2.真菌感染：像灰指甲这类真菌感染，也有很大可能会导致指甲盖凹陷。
三、指甲根部的甲母质部位出现异常：
(1)末梢循环障碍：这会使得指甲部位的循环系统出现故障，从而导致指甲受损，引起大拇指凹陷症状。
(2)先天性外胚叶发育不良：这种情况会致使指甲部位的相关功能异常，进而造成指甲盖凹陷。
总之，当出现大拇指甲盖凹陷时，患者应积极去明确病因，并采取相应的治疗措施，以防止病情进一步恶化。