右侧附件囊肿的症状表现多样。部分患者可能没有明显症状，是在体检时偶然发现。而有些患者可能会出现腹部不适，比如下腹部隐隐作痛，这种疼痛一般程度较轻，可能持续存在或者间断发作。
月经方面的症状
月经周期改变： 右侧附件囊肿可能会影响卵巢的正常功能，从而导致月经周期出现变化。比如原本规律的月经，可能会出现周期延长或缩短的情况，有的女性月经周期可能从28天左右变为35天甚至更长时间。月经量异常： 有的患者会出现月经量增多的情况，原本一次月经用1 - 2包卫生巾，可能会增加到3 - 4包；也有部分患者会出现月经量减少的状况，月经量明显比以前少很多。
腹部体征相关症状
腹部包块： 当右侧附件囊肿较大时，女性自己可能在腹部摸到包块。一般在清晨空腹、膀胱排空时更容易摸到，包块质地可能较软或中等硬度，可活动或固定。比如囊肿直径超过5厘米时，更有可能摸到腹部包块。腹胀感： 囊肿较大时还可能引起腹胀，患者会感觉肚子胀满，食量可能会受到影响，吃一点东西就觉得饱腹感很强。有些患者还可能伴有腰围增粗的现象，自己会发现裤子腰头变紧了。
其他相关症状
压迫症状： 如果右侧附件囊肿压迫到膀胱，可能会出现尿频、尿急的症状；压迫到直肠，可能会有便秘等表现。另外，少数患者可能会出现腰酸、下腹坠胀等不适感觉，尤其是在长时间站立、行走或者劳累后，症状可能会加重。如果囊肿发生扭转等并发症，就会出现突然的剧烈腹痛，同时可能伴有恶心、呕吐等症状，这种情况需要紧急就医处理。