卵巢早衰通常与遗传因素有关，部分女性携带特定基因突变，会增加卵巢早衰的发生风险，且这种遗传倾向可能在家族中呈现。
自身免疫因素
自身免疫系统紊乱时，免疫系统可能错误地攻击卵巢组织，破坏卵巢的正常结构和功能，引发卵巢早衰。例如，患有自身免疫性甲状腺疾病等自身免疫性疾病的女性，发生卵巢早衰的概率相对较高。
医源性因素
某些医疗操作或治疗可能导致卵巢早衰，如盆腔手术损伤卵巢血管，影响卵巢血液供应；化疗药物在杀死癌细胞的同时，也可能对卵巢的生殖细胞造成损伤，进而引发卵巢早衰，尤其是青少年患者在接受化疗后更易出现这种情况。
生活方式因素
长期熬夜、过度吸烟饮酒等不良生活方式会影响内分泌系统的稳定，干扰卵巢的正常功能，增加卵巢早衰的发生几率。长期精神压力过大也会通过神经内分泌调节影响卵巢功能，导致卵巢早衰。