早晨起来尿液发红可能由食物、药物、输尿管结石、肾小球肾炎等因素导致。以下是关于早晨起来尿液发红的原因和治疗方法的详细阐述：
一、食物：
若睡前食用了红心火龙果等含有花青素的食物，体内尿液会被花青素染色，进而致使早晨起来尿液发红。这种情况通常无需特殊治疗，一般可自行恢复正常。
二、药物：
当服用苯妥英钠片、利福平片等药物时，这些药物在肾脏代谢过程中会产生红色素，色素随尿液排出，引起早晨尿液发红。此时一般通过多饮水以促进尿液排泄，可改善症状。
三、输尿管结石：
长期饮水量较少可能引发该疾病，结石可能会刮伤周围组织，导致尿液发红。治疗方法通常在医生建议下采取手术治疗较好，常用的如腹腔镜下微创手术。
四、肾小球肾炎：
可能因遗传、感染等原因诱发，患上肾小球肾炎会使肾小球基底膜断裂，从而出现尿血、少尿等症状。可在医生诊断后进行药物治疗，比如使用百令胶囊、肾炎康复片等。
早晨起来尿液发红的注意事项：因每位患者的病因不同，在治疗时务必严格遵循医嘱。