肾囊肿可采用的手术方法需医生根据患者自身情况判断，具体包括开放性囊肿切开减压术、经皮穿刺硬化术、输尿管软镜手术和腹腔镜下肾囊肿去顶术。
一、开放性囊肿切开减压术：采用连续硬膜外麻醉，于第11肋间或12肋下缘切开，依次切开至后腹膜间隙，然后分离并暴露囊肿，切开囊肿壁，吸去囊液，在距离肾实质约5mm处剪去囊肿壁。此手术创伤大、恢复慢且并发症多，如切口感染、肺不张、静脉栓塞以及心脑血管意外等。随着手术器械及技术的不断完善，目前这种开放的肾囊肿切开手术已基本被淘汰。
二、经皮穿刺硬化术：是通过经皮穿刺抽去囊内液体后注入硬化剂来进行治疗，手术创伤较小，但受囊肿位置限制较大。对于肾中部及靠近集合系统的囊肿，存在硬化剂渗入肾实质而引起严重损伤的风险，而且对于直径大于10cm的囊肿治疗效果不理想，复发率也较高。
三、输尿管软镜手术：通过人体泌尿系统这一自然腔道逆行进入肾脏集合系统，可直接抵达或接近肾盂旁囊肿表面来处理囊壁，属于微创手术。不过因输尿管软镜反复进出输尿管、肾盂易造成黏膜损伤，尤其易发生在输尿管狭窄及扭曲部位。
四、腹腔镜下肾囊肿去顶术：在腹腔镜下通过腹膜后入路，于腋中线髂嵴上做切口，逐层分离探入腹膜后间隙，植入气囊，剔除腹膜外脂肪，切开肾周的筋膜，明确囊肿位置后，切开囊肿壁并吸净囊液，留置引流管后缝合切口。该手术方式相较于常规后腹腔镜手术，可明显减少术中出血和手术时间，术中意外损伤、术后并发症及复发情况也较少。
总结：肾囊肿手术方法多样，各有特点及适用情况，医生会综合考虑患者具体状况来选择合适的手术方式。