亚急性甲状腺炎常见症状多样，一般起病前1~3周常有上呼吸道感染病史。典型症状包括甲状腺部位疼痛，疼痛可从一侧开始，很快波及另一侧，甚至整个甲状腺，疼痛程度不一，有的患者疼痛可放射至耳部，这种疼痛可持续1~2周，少数患者疼痛会持续数月。
症状表现之全身症状
发热情况： 多数患者会出现不同程度的发热，体温一般在38℃左右，少数患者体温可超过38.5℃，发热可持续1~3周。全身不适： 患者还会感觉全身乏力，没什么精神，有的患者会伴有肌肉酸痛，尤其是在活动后肌肉酸痛感可能会加重。
症状表现之甲状腺局部表现
甲状腺肿大： 甲状腺会出现不同程度的肿大，肿大的甲状腺质地较硬，触痛明显。肿大的甲状腺可不对称，部分患者一侧甲状腺肿大明显，另一侧相对较轻。甲状腺结节： 有些患者在甲状腺肿大的基础上可触及结节，结节大小不一，随着病情变化，结节的大小和质地也可能会改变，有的结节会逐渐缩小，有的则可能持续存在一段时间后才消退。
症状表现之甲状腺功能相关表现
甲亢表现： 在发病初期，由于甲状腺滤泡被破坏，甲状腺激素释放入血，部分患者会出现甲亢症状，如心慌、手抖、多汗、食欲亢进但体重减轻等。一般这种甲亢表现持续时间较短，可能1~2个月左右。甲减表现： 随着病情进展，当甲状腺滤泡细胞受损严重，甲状腺激素合成减少时，少数患者会出现甲减表现，如怕冷、乏力、嗜睡、记忆力减退、便秘等，不过这种甲减表现大多是暂时性的，多数患者甲状腺功能可逐渐恢复正常，少数患者可能会遗留永久性甲减。