囊肿型痤疮是比较严重的痤疮类型，治疗需综合多方面。一般可通过外用药物、口服药物以及物理治疗等方法来改善，通常需要数周甚至数月的治疗过程。
外用药物选择
过氧化苯甲酰： 可以缓慢释放新生态氧和苯甲酸，具有杀灭痤疮丙酸杆菌、抗炎的作用。可溶解皮肤表面角质，对囊肿型痤疮有一定的治疗效果，每天早晚各使用一次，涂抹在患处。抗生素类药膏： 如克林霉素磷酸酯凝胶，能抑制痤疮丙酸杆菌的生长，减轻炎症反应。但要注意长期使用可能会导致细菌产生耐药性，一般每天外用2-3次。
口服药物治疗
抗生素： 比如四环素类的米诺环素，能抑制痤疮丙酸杆菌的蛋白合成，发挥抗炎作用。但孕妇、8岁以下儿童禁用，使用过程中可能会出现胃肠道不适等不良反应。异维A酸： 是治疗重度痤疮的常用药物，可减少皮脂腺分泌，改善毛囊皮脂腺导管角化。不过它有较大的副作用，可能会引起皮肤干燥、口唇干裂等，而且孕妇绝对禁用，服用期间需严格避孕。
物理治疗手段
光动力治疗： 利用光敏剂经过外搽、口服或注射进入体内，被皮脂腺、毛囊内的痤疮丙酸杆菌吸收，再经特定波长的光照射后，产生单线态氧，破坏皮脂腺和痤疮丙酸杆菌，从而达到治疗囊肿型痤疮的目的。一般需要多次治疗，每次间隔1-2周。红蓝光治疗： 红光可以穿透到皮肤深层，刺激细胞新陈代谢，促进细胞生长；蓝光能杀灭痤疮丙酸杆菌。通常每周进行2-3次治疗，一个疗程大概需要10-15次。
日常护理要点
皮肤清洁： 每天用温和的洁面产品清洁面部，但要注意不能过度清洁，以免破坏皮肤的屏障功能。一般早晚各清洁一次即可。饮食调整： 要减少高糖、高脂肪食物的摄入，如蛋糕、油炸食品等，多吃新鲜的蔬菜和水果，保持饮食的均衡。同时要多喝水，保持大便通畅。生活作息： 保证充足的睡眠，每天尽量保证7-8小时的睡眠时间，避免熬夜。因为熬夜会影响内分泌，加重痤疮的症状。