黄水疮主要通过局部用药治疗，一般经过规范处理，数天内可改善。
局部处理方法
清洁创面： 首先要用生理盐水或3%的硼酸溶液清洗患处，把表面的脓液、分泌物等清理干净，保持创面清洁，利于后续用药。比如可以用干净的纱布蘸取生理盐水轻轻擦拭患处，每天可进行2 - 3次。外用药物选择： 常用的有莫匹罗星软膏，它对金黄色葡萄球菌等有较好的抗菌作用；还有夫西地酸乳膏，也能有效抑制细菌感染。如果水疱较大，需要用消毒过的注射器将疱液抽出后再用药。
全身用药情况
轻症一般无需全身用药： 对于症状比较轻微，只有局部少量皮疹的患者，单纯局部用药往往就可以控制病情。但如果皮疹范围较广、病情较重，比如伴有发热等全身症状时，可能需要全身使用抗生素。常用的口服抗生素有头孢类抗生素，不过具体使用哪种抗生素需要医生根据病情来判断，比如头孢克肟等，但要注意对头孢过敏的人不能使用。
特殊人群注意事项
儿童患者： 儿童得了黄水疮，在用药时要更加谨慎。局部用药时要注意药物的刺激性，选择温和且有效的药物。如果需要全身用药，要严格按照儿童的体重等情况来调整药物剂量，避免使用可能对儿童有不良影响的药物。比如儿童使用莫匹罗星软膏相对比较安全，但全身用抗生素时要遵循儿童用药的剂量标准。孕妇患者： 孕妇患黄水疮时，局部用药相对安全些，可选择对胎儿影响较小的药物。但全身用药要非常谨慎，因为一些抗生素可能会通过胎盘影响胎儿，必须在医生的严密评估下，权衡利弊后才能使用合适的药物，医生会尽量选择对胎儿影响最小的药物来治疗。