宝宝打完流脑疫苗后发烧有可能是正常反应。可采取物理或药物方法来处理。
一、物理降温：
注射流脑疫苗后大概三天左右可能出现轻微发烧，若体温未超过38.5度，通常属正常。可通过物理方法降温，如使用退热贴，或让患儿多喝温开水，能缓解发烧现象，一般一到两天左右症状会逐渐消失。
二、药物治疗：
注射流脑疫苗后发烧若超过38.5度，可能并非单纯由疫苗引起，还可能存在炎症感染，需及时观察患儿有无其他不适症状。应带患儿到正规医院检查，配合医生服用退烧药物治疗。治疗期间要注意身体保暖，避免着凉，同时注意休息，保证充足睡眠，饮食上以清淡为主，适量多喝温开水。
总之，宝宝打完流脑疫苗后发烧要根据具体情况选择合适的处理方法，若有异常应及时就医。