女性小便时尿道刺痛可能由以下原因引起：
1.感染：
尿道炎、膀胱炎等泌尿系统感染是常见原因，细菌、病毒或其他病原体感染尿道，引起炎症反应。
性传播疾病，如淋病、非淋菌性尿道炎等，也可能导致尿道刺痛。
2.细菌感染：
大肠杆菌是最常见的引起尿道感染的细菌。
其他细菌如变形杆菌、克雷伯氏菌等也可能导致感染。
3.尿道损伤：
尿道器械检查、性生活过度或粗暴、尿道内异物等可导致尿道黏膜损伤。
4.尿道结石：
尿道内的结石可刺激尿道黏膜，导致疼痛和排尿困难。
5.尿道口炎：
尿道口周围的炎症也可能引起尿道刺痛。
6.其他原因：
过敏反应、化学物质刺激。
膀胱过度活动症等也可能导致尿道刺痛。
需要注意的是，尿道刺痛还可能是其他更严重疾病的症状，如泌尿系统肿瘤、肾盂肾炎等。如果尿道刺痛持续存在或伴有其他症状，如尿频、尿急、尿不尽、血尿等，应及时就医，进行相关检查和诊断。医生通常会进行尿液分析、细菌培养等检查，以确定具体的病因，并给予相应的治疗。
在就医之前，建议女性保持良好的个人卫生习惯，多喝水，以促进排尿，有助于缓解症状。同时，避免过度劳累、饮酒和食用辛辣刺激性食物。