做肠镜无痛的好。
普通肠镜是患者在清醒状态下进行的检查，是对整个结肠的检查。因为肠腔长且狭窄，肠镜需从肛门进入直至回肠的回盲部，全程约1米甚至更长。在此过程中，为让肠管缩短以达结肠末端从而观察完整结肠，通常会采用勾拉肠管的技术性检查手段，这易让患者产生疼痛。而且做肠镜时要向肠腔内充气撑开肠管，也会给患者带来不适，若患者耐受性差，检查难以顺利完成。
无痛肠镜则是在检查时给患者进行基础麻醉，使其处于睡眠状态，这样医生检查时患者几乎感觉不到异物，医生操作更便利，也更易发现病变，从而达成肠镜检查目的。不过，无痛肠镜价格比普通肠镜高，且患者自身身体条件要能耐受基础麻醉。若患者身体条件差，如心脏、呼吸功能不佳，可能就无法接受麻醉，此时只能选择普通肠镜检查。
总结：做肠镜无痛的更好，但无痛肠镜价格高且对患者身体条件有要求，普通肠镜可能让患者感觉不适且对耐受性有要求，需根据具体情况选择。