预防脑血栓一般不通过打特定药物来常规预防，而是通过控制基础疾病、改善生活方式等综合措施来降低风险。但如果是短暂性脑缺血发作等需要紧急预防的情况，可能会用到抗凝、抗血小板等药物。比如对于有高血栓风险的房颤患者，可能会使用华法林等抗凝药，但华法林需要定期监测国际标准化比值（INR），使其维持在2-3之间，不过它有出血等风险。
抗血小板聚集药物预防
阿司匹林： 是常用的抗血小板聚集药物，一般可以降低脑血栓形成的风险约20%左右。它通过抑制血小板的聚集功能，阻止血栓形成。但有消化道溃疡、出血倾向的人要慎用，老年人使用时需关注胃肠道反应。氯吡格雷： 也是抗血小板药物，对于不能耐受阿司匹林的患者可以选用。它的作用机制是抑制血小板表面的ADP受体，从而抑制血小板聚集。不过它可能会有出血等不良反应，使用时要监测血常规等指标。
抗凝药物预防
华法林： 属于香豆素类抗凝药，能通过抑制维生素K依赖的凝血因子合成来发挥抗凝作用。但它的剂量个体差异大，需要频繁监测INR来调整剂量，而且饮食中维生素K的摄入会影响其效果，比如大量进食绿叶蔬菜等可能会降低药效。新型口服抗凝药： 如利伐沙班等，相比华法林，它不需要频繁监测INR，药物相互作用相对较少。但价格相对较高，而且也有出血的风险，使用时同样需要在医生评估下根据患者情况选择。
改善脑血管循环药物辅助预防
银杏叶制剂： 有一定的改善脑血管循环、增加脑血流量的作用，可能对预防脑血栓有一定辅助效果。它可以通过扩张脑血管，改善脑部的血液循环。不过其确切的预防效果还需更多大规模研究证实，一般作为辅助用药。丁苯酞： 可以改善脑缺血区的微循环和血流量，促进神经功能恢复。对于存在脑血管缺血风险的人群，可能有一定的保护脑血管作用，但它主要用于急性脑梗死的治疗辅助，在预防方面也有一定应用，但需要在医生指导下使用。
控制基础疾病相关药物预防
降压药： 对于高血压患者，控制血压是预防脑血栓的重要措施。如氨氯地平可以通过扩张血管来降低血压，将血压控制在140/90mmHg以下（一般情况），能显著降低脑血栓发生风险约30%左右。但降压要平稳，避免血压波动过大。降糖药： 对于糖尿病患者，使用二甲双胍等降糖药控制血糖，将糖化血红蛋白控制在7%以下，也能降低脑血栓的发生风险。高血糖会损伤血管内皮，促进血栓形成，控制血糖可以改善血管内皮功能，减少血栓形成的风险。