包皮炎的治疗药物选择需根据病因来定，一般细菌感染引起的包皮炎，可选用莫匹罗星软膏等抗生素类药物，通常坚持用药1~2周左右可能会有较好改善。
细菌感染引发的包皮炎用药
局部外用抗生素药膏： 像莫匹罗星软膏就比较常用，它能抑制细菌生长，起到抗感染的作用。使用时要注意保持局部清洁，先清洗包皮和龟头后再涂抹药膏。高锰酸钾溶液清洗： 可以用1:5000的高锰酸钾溶液进行浸泡清洗，能起到一定的杀菌消炎效果，但要注意浓度，避免浓度过高刺激皮肤。
真菌感染导致的包皮炎用药
抗真菌药膏： 例如克霉唑软膏，它能抑制真菌的生长繁殖。使用时同样要清洁局部，然后均匀涂抹在患处。一般需要连续使用几周，直到症状完全消失。碳酸氢钠溶液清洗： 用2%~4%的碳酸氢钠溶液清洗包皮和龟头，能改变局部酸碱度，抑制真菌生长，清洗后再涂抹抗真菌药膏效果更好。
过敏因素引起的包皮炎用药
糖皮质激素类药膏： 如果是过敏引起的包皮炎，短期使用弱效的糖皮质激素药膏，如氢化可的松软膏，能减轻炎症和过敏反应。但要注意不能长期大面积使用，以免引起不良反应。抗组胺药物： 对于过敏较严重的情况，可能需要口服抗组胺药物，如氯雷他定片，能缓解过敏引起的瘙痒等症状，但要在医生指导下使用，尤其要注意儿童的用药剂量等问题。
日常注意事项
保持局部清洁卫生： 每天用温水清洗包皮和龟头，尤其是包皮过长的人，要将包皮翻开彻底清洗，避免污垢残留引发炎症。避免刺激： 患病期间要避免性生活，避免食用辛辣刺激性食物，穿着宽松透气的内裤，减少对包皮的摩擦和刺激。及时处理基础疾病： 如果有包皮过长或包茎的问题，在炎症消退后，一般建议考虑行包皮环切术，从根源上预防包皮炎的复发，尤其是成年男性反复出现包皮炎时，手术是较好的解决办法。