男性小便时尿道疼可能由饮食辛辣、软组织损伤、上火、尿道炎、肾结石等因素引发，需对症治疗。
一、饮食辛辣：若男性近期护理不当，饮食过于辛辣刺激，可能损伤尿道黏膜，从而出现刺激性疼痛症状。此时患者需注重护理，保持饮食清淡，适当食用新鲜水果和蔬菜，多数情况下能缓解症状。
二、软组织损伤：男性患处若近期遭受外力碰撞或过度摩擦，可能因外力作用使尿道黏膜充血、水肿，进而导致疼痛。建议患者适当进行按摩、湿敷，以利于改善血液循环，助力病情缓解。
三、上火：该病症指人体阴阳失衡后出现的内热证候。当男性合并上火时，可能因内火积聚而出现口苦、头晕、尿痛等症状。男性患者可在医生指导下使用牛黄清胃丸、清热解毒口服液、金银花颗粒等药物来清除内火。
四、尿道炎：这是尿道黏膜的炎症性感染，因炎症刺激会出现尿痛、尿频、尿急等现象，可能还伴有发热症状。男性患者可在医生指导下使用头孢克洛颗粒、盐酸米诺环素片、左氧氟沙星片等药物进行治疗。
五、肾结石：是体内部分成分在肾脏形成结石而导致男性出现一系列以泌尿系统症状为主的疾病。可能因结石影响使局部软组织受损，常出现尿痛现象，严重时还会有血尿症状。建议男性患者在医生指导下使用金钱草颗粒、排石颗粒、尿石通丸等药物控制病情，必要时可采取体外超声波碎石术以促进结石排出。
此症状病因较为复杂，务必及时就医治疗，以防病情进一步恶化。