怀孕早期肚子疼流血可能由以下原因引起：
一、先兆流产：指怀孕28周前阴道有少量出血，伴腰部疼痛、腹部疼痛，从而导致怀孕早期肚子疼流血。其发病原因较为复杂，可能与环境因素、母体因素、胚胎因素、父亲因素等有关。比如，环境中存在有害化学物质或放射性物质可能影响胚胎发育；母体方面，若患有全身性疾病、内分泌异常、生殖器官异常等可能增加先兆流产风险；胚胎自身存在染色体异常等问题也容易引发；父亲的精子染色体异常同样可能导致。
二、异位妊娠：受精卵在宫腔以外部位着床，常见于输卵管，也有少部分在腹腔、宫颈、卵巢等部位。当胚胎组织破裂时，会引起阴道少量出血，进而造成怀孕早期肚子疼流血。比如，输卵管炎症、输卵管手术、输卵管发育不良或功能异常等因素，都可能使受精卵在输卵管着床，随着胚胎发育，一旦破裂就会出现相应症状。
总之，怀孕早期出现肚子疼流血情况，应高度重视并及时就医，明确具体原因以便采取针对性的治疗措施。