治疗结石的方法有多种，比如对于较小的肾结石，直径小于0.6厘米的结石，有50%左右的概率通过大量饮水、适当运动等方式自行排出。
药物治疗
利尿剂： 像氢氯噻嗪等利尿剂可增加尿液排出，帮助小结石随尿液排出，但需在医生指导下使用，避免电解质紊乱等问题。溶石药物： 对于尿酸结石等特定类型结石，可使用别嘌醇等药物来降低尿酸水平，促进结石溶解，但药物起效相对较慢，一般需要持续用药一段时间。
体外冲击波碎石
适用情况： 适用于直径在2 - 5厘米之间的肾结石或输尿管上段结石。它是利用高能冲击波聚焦后作用于结石，将结石击碎成细砂状，然后随尿液排出体外。注意事项： 治疗后可能会有短暂的血尿和腰部酸痛，一般休息后可缓解。但孕妇、出血性疾病患者等不适合该治疗方法。
手术治疗
输尿管镜取石术： 适用于中下段输尿管结石以及一些较大的、体外冲击波碎石难以粉碎的肾结石。医生通过尿道插入输尿管镜，找到结石后用激光等将结石击碎并取出。开放性手术： 现在已经较少采用，主要用于一些非常复杂、其他治疗方法无法解决的结石问题，手术创伤较大，术后恢复时间较长。
内镜手术
经皮肾镜取石术： 适用于较大的肾结石，如直径大于2厘米的结石。通过腰部建立通道，将肾镜插入肾脏，利用激光、超声等设备将结石击碎取出。这种手术创伤相对体外冲击波碎石和输尿管镜取石术稍大，但对于较大结石的清除效果较好。