肠胃差引起的口臭可依据不同病因选择合适药物来治疗，比如藿香清胃胶囊、牛黄清胃丸、奥美拉唑肠溶胶囊、阿莫西林等。具体如下：
一、如果口臭是因胃火旺盛导致的，可口服中药藿香清胃胶囊来治疗，此药能够清热化湿、健脾消食。也可服用牛黄清胃丸，它能清胃泻火、润肠通便，这两者都可以对胃肠疾病引发的胃火旺盛、口臭等问题进行调节。
1.藿香清胃胶囊：主要成分为广藿香、栀子、防风、南山楂、六神曲、石膏、甘草等。具有清热化湿、醒脾消滞的功效。适用于脾胃伏火引起的消化不良、脘腹胀满、不思饮食、口苦口臭等症。
2.牛黄清胃丸：含有牛黄、大黄、菊花、麦冬、薄荷、石膏、栀子、玄参、番泻叶、黄芩、连翘、桔梗、黄柏、甘草等成分。有清胃泻火、润燥通便的作用。常用于心胃火盛、头晕目眩、口舌生疮、牙龈肿痛、乳蛾咽痛、便秘尿赤等情况。
二、倘若口臭是由幽门螺杆菌感染引起的，则需要四联疗法治疗，可以在医嘱下服用如奥美拉唑、阿莫西林等药物。
1.奥美拉唑肠溶胶囊：主要成分是奥美拉唑。适用于胃溃疡、十二指肠溃疡、应激性溃疡、反流性食管炎和卓-艾综合征（胃泌素瘤）等。
2.阿莫西林：为半合成广谱青霉素类药。用于敏感菌（不产β内酰胺酶菌株）所致的中耳炎、鼻窦炎、咽炎、扁桃体炎、急性支气管炎、肺炎等呼吸道感染，泌尿生殖道感染，皮肤软组织感染等。
三、若是消化不良引起的口臭，可以口服乳酸菌素片或者健胃消食片等，治疗效果较好。同时要控制饮食，多喝水，注意口腔卫生，每天饭后要刷牙。有口臭的患者应多食用一些清新口气的食物以及蔬菜，因为蔬菜含有大量的纤维素，可帮助消化、解决便秘问题，像芹菜等有助于消灭齿菌斑的食物也有助于消除口臭。
总之，对于肠胃差引起的口臭，要明确病因后选择针对性的药物进行治疗，同时注意生活中的各种调理。