怀孕40天自然流产对身体伤害通常较小。以下是具体分析：
一、原因方面：怀孕40天自然流产可能源于胚胎发育过程中出现胚胎发育不良，也可能和母体因素存在一定关联。
1.胚胎因素：在胚胎发育时，如果自身存在缺陷，无法正常发育，就可能导致自然流产。
2.母体因素：比如母体患有某些疾病，或内分泌失调等，都可能影响胚胎发育，引发自然流产。
二、影响方面：此时胎儿较小，自然流产一般不太会对女性身体造成严重影响，做好日常护理保健工作即可。
三、后续处理方面：
1.关注妊娠组织排出情况：流产后需要留意宫腔内妊娠组织是否完全排净。
(1)若已彻底排净：通常无需过多治疗。
(2)若有残留：可在医生指导下使用新生化颗粒等药物促进恶露排出，否则治疗不及时可能造成宫腔感染。
2.观察身体症状：出现自然流产后要密切观察身体状况，一旦有异常情况发生，应立即就医并积极配合医生治疗。
总之，怀孕40天自然流产后要做好各方面的关注和处理，以保障身体恢复。