早上起来拉肚子可能由多种原因引起。比如，腹部受凉是常见因素之一，夜间睡眠时若没盖好被子，腹部受冷刺激，肠道蠕动加快，就可能导致早上起来拉肚子。
饮食因素导致
食物过敏或不耐受： 如果前一天吃了过敏或不耐受的食物，像有些人对乳糖不耐受，前一天喝了牛奶，早上就可能拉肚子。还有些人对某些海鲜过敏，吃了海鲜后也容易出现晨起腹泻情况。进食过多生冷食物： 前一天吃了大量冰镇水果、冷饮等生冷食物，会刺激肠道，使得肠道功能紊乱，进而引发早上起来拉肚子。比如一次性吃了很多冰镇西瓜，第二天早上很可能就会拉肚子。
肠道疾病影响
肠易激综合征： 这是一种常见的功能性肠病，患者肠道比较敏感，早上起来时可能因为肠道蠕动等原因引发腹泻。一般这种情况还可能伴有腹痛，疼痛位置多在肚脐周围，排便后疼痛会有所缓解。慢性肠炎： 如慢性结肠炎等，肠道长期处于炎症状态，早上起来时肠道受到刺激，容易出现腹泻症状。患者可能还会有大便不成形、黏液便等表现，病程较长，需要长期调理。
其他因素
内分泌疾病： 像甲状腺功能亢进症患者，由于甲状腺激素分泌过多，会加快机体新陈代谢，包括肠道的蠕动也会加快，从而可能导致早上起来拉肚子。患者通常还会伴有心慌、手抖、消瘦等症状。药物副作用： 某些药物可能会引起腹泻的副作用，比如一些抗生素，使用后可能会破坏肠道正常菌群平衡，导致肠道功能失调，出现晨起腹泻。如果正在服用可能有此副作用的药物，需要咨询医生是否需要调整用药。