皮肤细菌感染和真菌感染存在诸多区别，主要包括以下方面：一、致病菌不同：1.皮肤细菌感染常见致病菌有金黄色葡萄球菌、绿脓杆菌、链球菌等。2.真菌感染的致病菌通常为念珠菌、毛癣菌、霉菌等。二、引起的疾病不同：1.细菌感染可引发疖、痈等皮肤疾病，毛囊炎也可能由细菌感染导致。2.真菌感染可引起手足癣、体癣、甲癣、头癣等。三、临床表现不同：1.细菌感染所致皮肤病常以局部红、肿、热、痛为主要表现，甚至有时会伴有发热、恶心、食欲不振等全身症状。2.真菌感染主要呈现皮肤症状，如红斑、脱皮、皮肤瘙痒、丘疹等。
此外，由于疾病类型不同，皮肤细菌感染和真菌感染所使用的药物也各异。细菌感染者一般以抗生素治疗为主，而真菌感染者主要使用抗真菌药物治疗。具体用药需结合自身情况，在医生指导下进行对症处理。总之，要明确区分皮肤细菌感染和真菌感染，以便采取正确的治疗措施。