引起精子畸形的原因有很多，以下是一些常见的原因：
1.精索静脉曲张：精索静脉曲张会导致睾丸局部温度升高，血管活性物质增加，从而影响精子的发生，导致精子畸形。
2.生殖系统感染：生殖系统感染如附睾炎、精囊炎、前列腺炎等，可能会引起精浆中的营养成分缺乏，酸碱度、供氧、营养、代谢等均不利于精子活动和存活，从而导致精子畸形。
3.内分泌异常：男性正常生精功能依赖于下丘脑-垂体-性腺轴功能的正常，其中任何一个环节障碍，都会影响生精功能，导致精子畸形。
4.吸烟酗酒：吸烟和酗酒是精子畸形的重要因素，吸烟会使精子畸形率明显升高，而酗酒则可导致精子活力降低。
5.其他因素：长期使用某些药物、接触放射性物质、阴囊局部长期高热、长期穿紧身内裤等，也可能会导致精子畸形。
如果男性发现精子畸形率高，应及时就医，进行详细的检查，以明确病因，并采取相应的治疗措施。同时，在日常生活中，应注意保持良好的生活习惯，避免吸烟酗酒，避免长期接触放射性物质，避免阴囊局部长期高热等。