根管治疗主要用于牙髓炎、根尖周炎等口腔内感染性疾病。根管治疗一次后牙特别疼，可能有如下原因。
一、生理因素：根管治疗时需打开牙髓腔进行清洗，这会形成一定创口，从而导致术后出现疼痛症状，此为正常生理现象。若疼痛较为严重，可使用阿司匹林等镇痛药物来止痛，通常数天后疼痛会逐渐消失。
二、牙髓腔压力过大：在根管治疗过程中打开牙髓腔，清洗并放置药物后进行封闭。若封闭后牙髓腔内压力过大，就会致使牙特别疼。建议先打开牙髓腔引流数天，之后再在牙髓腔内放置药物进行治疗，期间可让患者使用布洛芬等非甾体类抗炎止痛药物缓解症状。
三、根尖炎症未彻底引流：若打开牙髓腔后未做到彻底清洗、引流，仍存在部分炎症组织和分泌物，那么根管治疗后也可能继续有疼痛症状。建议再次对牙髓腔进行清洗、引流，将炎症组织清理干净，同时可使用阿莫西林等药物进行抗感染治疗，待炎症消退后再考虑封药。
四、牙髓组织仍有活力：一般在第一次根管治疗时，会使用药物来杀灭局部神经，以降低牙髓组织活力，防止出现严重疼痛。若药物刚开始起效或者局部神经组织杀灭不彻底，牙髓组织仍有活力，也可能造成根管治疗后牙疼。此时，可使用阿司匹林等止痛药物减轻疼痛症状，并继续观察。随着牙髓失活剂逐渐发挥作用，疼痛症状就会逐渐减轻直至最终消失。
五、根管消毒药物刺激：若疼痛是由于根管消毒药物如甲醛甲酚、樟脑苯酚等刺激导致的，则建议去除药物并进行根管冲洗，接着放置更为温和的根管消毒药物如氢氧化钙制剂等进行治疗，这样就能缓解疼痛症状。
总之，根管治疗一次后牙特别疼可能由多种因素引起，应根据具体情况进行分析和处理。