脚底长小水泡的原因比较多，常见的有以下几种：
1.湿疹：一种皮肤炎症反应，可能与过敏、环境因素、遗传等有关。表现为脚底出现红斑、丘疹、水疱，并伴有瘙痒。可以外用糖皮质激素乳膏，如糠酸莫米松乳膏、丁酸氢化可的松乳膏等；瘙痒明显时，可口服抗组胺药，如氯雷他定、西替利嗪等。
2.足癣：由真菌感染引起，具有传染性。表现为足底出现水疱、脱屑、瘙痒，水疱破裂后可能会出现糜烂、渗出。可外用抗真菌药物，如酮康唑乳膏、特比萘芬乳膏等；严重者可口服抗真菌药，如伊曲康唑、氟康唑等。
3.汗疱疹：病因尚不明确，可能与精神因素、多汗、过敏等有关。表现为手掌或足底出现水疱，有时可伴有瘙痒或烧灼感。可外用炉甘石洗剂、糖皮质激素乳膏等；瘙痒明显时，可口服抗组胺药。
4.其他：摩擦、接触性皮炎、手足口病等也可能导致脚底长小水泡。
如果脚底长小水泡，建议及时就医，明确诊断后，在医生的指导下进行治疗。同时，要注意保持脚部清洁干燥，避免搔抓，以免引起感染。