新生儿室间隔缺损通常是由于在母体中先天发育不良所致，影响因素众多。
一、可能源于外界感染，比如母亲在孕期受到某些病毒或细菌的侵袭。
二、可能是母亲没有充分注意休息，孕期过度劳累等。
三、也可能是母亲自身存在疾病等因素导致。
这种情况下需要及时进行心脏彩超检查以明确室间隔缺损的大小状况。如果宝宝没有口周青紫现象，也未影响局部血流，暂时可不作处理，只需每三到六个月复查一次即可。同时要密切观察孩子的生长发育情况以及吃奶量情况。因为室间隔缺损过大时，可能因局部肺淤血而引发反复呼吸道感染，甚至出现生长发育落后，严重时还会有口周青紫表现。具体情况需依据症状、体征来确定。室间隔缺损特别小的情况下，一般一岁之内有部分可自行愈合，不能愈合时则可进行手术治疗。
总之，对于新生儿室间隔缺损，要明确其成因，做好检查和观察，根据具体情况选择合适的处理方式。